Ngày 9/7/2020, Ban kỷ luật LĐBĐVN đã ban hành các quyết định kỷ luật đối với HLV Nguyễn Bảo Trung cùng trợ lý và các học trò của mình do có những phản ứng trong trận đấu giữa K. Sài Gòn FC và Cao Bằng (lượt IX ngày 4/7/2020).
Cụ thể HLV Trung “Núi” nhận án phạt 2.500.000đ, bị đình chỉ làm nhiệm vụ 1 trận do “có hành vi phản ứng với trọng tài trong trận đấu”; cầu thủ số 2 Mai Thành Danh Toại bị phạt 7.500.000đ và cấm thi đấu 2 trận do có hành vi xâm phạm thân thể ông Phạm Trần Thành Tín- trợ lý HLV Cao Bằng; trợ lý Đào Duy Vương nhận án phạt cảnh cáo do có hành vi phản ứng với trọng tài trong trận đấu cùng với cầu thủ số số 5 Nguyễn Hồng Kông bị phạt 7.500.000đ và cấm thi đấu 2 trận tiếp theo.
Sau khi quyết định được ban hành, HLV Bảo Trung ngay lập tức đã có những ý kiến phản bác lại về án phạt này “Chúng tôi hoàn toàn không đồng ý với án phạt mà Ban kỷ luật VFF đưa ra. Về tình huống của Danh Toại, đó là thời điểm đội chúng tôi đang chơi tấn công để tìm kiếm bàn thắng nhưng trợ lý của Cao Bằng đã lùa bóng đi cố tình cản trở Toại đưa bóng vào cuộc. Sau đó có xảy ra tranh cãi và cả Toại lẫn trợ lý Thành Tín đều phải nhận thẻ vàng. Nhưng đến bây giờ lại đưa ra án phạt nguội với mỗi cầu thủ của K. Sài Gòn liệu có công bằng hay không?”.
Trong trận đấu giữa K. Sài Gòn và Cao Bằng, mặc dù không có tên trong danh sách đăng ký do nhận đủ 2 thẻ vàng nhưng cầu thủ số 5 Nguyễn Hồng Kông vẫn phải nhận án phạt nguội do có hành vi phản ứng trọng tài, giám sát. ” Hồng Kông không hề có trong danh sách, cậu ấy ngồi trên khán đài theo dõi và cổ vũ như một khán giả bình thường vậy hà cớ gì lại có án phạt cấm thi đấu 1 trận và phạt tiền cậu ấy? Chả lẽ bây giờ khán giả đi xem cũng bị xử phạt hay sao?”
“Dẫu biết phải có cạnh tranh thì mới có phát triển, nhưng phải làm sao cho đúng. Ngay bản thân tôi, tôi cũng không hiểu lý do vì sao mà tôi cũng bị phạt. Trong suốt trận đấu tôi không hề có hành vi phản ứng với trọng tài mà như án phạt đã nêu. Trận đấu tiếp theo K. Sài Gòn gặp đối thủ là Thái Sơn Nam. Bây giờ VFF cấm tôi làm nhiệm vụ rồi cấm hai cầu thủ của đội thì cho hỏi chúng tôi lấy gì để đá với họ đây?” HLV Trung “Núi” bức xúc nói.
Người thuyền trưởng của K. Sài Gòn cũng chia sẻ thêm: “Về án kỷ luật này, sáng nay đội tôi đã làm một lá đơn kháng cáo gửi Ban kỷ luật và 1 kiến nghị lên LĐBĐ Việt Nam (VFF). Chúng tôi quyết kiến nghị đến cùng để đòi lại công bằng.”